Il Consiglio di Amministrazione della Veneranda Confraternita della SS. Trinità e San Giovanni Battista di Ovada è composto, a norma degli Statuti che ne regolano la vita (approvati nell'anno 2008), da undici membri, detti Consiglieri.
All' interno di questi si nominano le varie cariche che, in ordine decrescente di importanza, sono le seguenti:

- Primicerio: E' a capo del Consiglio e rappresenta la Confraternita.
- Primo e Secondo Guardiano: Sono le seconde cariche del Consiglio e sostituiscono il Primicerio in sua assenza.
- Tesoriere: Amministra le finanze della Confraternita.
- Segretario: E' incaricato dell' annotazione di ogni evento riguardante la Confraternita.
- Revisore dei conti: Sovrintende al controllo della correttezza dei bilanci della Confraternita.

Circa l'attività religiosa e di culto, la Confraternita è soggetta all' Autorità Religiosa competente, così come da Codice di Diritto Canonico vigente.
Attualmente ricopre la carica di Primicerio il Sig. Giorgio Zafferani di Ovada.